乔飞拿起手机,直接拨梁晓慧的电话。
只响了一声,对方就接通了。
“174大神!额,不对……乔飞,什么事?”电话另一边的声音有些惊讶。
“有点事情请教你…”乔飞说道。
“什么?有事情要请教我?你这么快就在学习生物信息学了?不错耶!”声音从惊讶转为了兴奋。
“我是正在研究。”乔飞不想让她失望,先肯定的说道。
果然,电话那头一阵欢呼…
“现有有点事情需要你帮个忙。”乔飞接着说道。
“没问题。”梁晓慧斩钉截铁的承诺:“说吧!”
“对于我缺失的那段dna,2.7kb的,我想知道这一段dna序列上有多少个snp,或者str也行,我对ncbi这个库不太熟悉,怕自己查的信息不准。”
“好的,没问题,str估计不会有的,因为这段dna是外显子,一般不会有str,snp肯定会有的,我马上去确认。话说ncbi你怎么能不会用,这可是学生物信息学的基础,你要尽快掌握哈,过两天不忙了我去教你,包教包会…”
电话那头滔滔不绝的热情,让乔飞莞尔。
……
用那段dna确定是否和蒋慕轩有关,必须知道这段序列上,有多少snp位点或者str信息。
因为人与人的dna序列,有99.9%都是相同的,必须测定那些人与人之间不同的核苷酸位点,才能说明问题,这也是亲缘关系鉴定的技术原理。
乔飞问梁晓慧这段序列上的snp与str变异,就是为了找到这段序列上的不同,如果这些人与人之间不同的点,和蒋慕轩却相同,就能够证明了。
snp,单核苷酸多态性,简单来说,指的是经常出现的单个dna位点的变异,这和单点基因突变只有不到1%人群概率不同,这种变异广泛存在。
比如发现某个基因位点,有70%的人是tt型,有19%是ct型,有11%是cc型,这三种类型的人,出生的时候,没有明显的个体差异。
如果这个基因位点有99%以上的人都是同一类型,只有不到1%的人不一样,这属于基因突变而不是snp变异,基因突变一般情况下,是会引起严重的疾病的。
从乔飞出生的2002年左右开始,世界范围内开始了针对snp变异的广泛研究,发现了这一类的变异,虽然不会直接导致个体的差异,却会让人产生一些不同患上某种疾病概率的不同。
就像上面的基因型,大部分人是tt型的,结果经过统计发现,ct型的人,比tt型的人,更容易患上糖尿病…
所以大概2008年左右,整个世界范围内,出现了大量针对snp位点进行测序服务的公司,通过检测snp变异,告诉受检者容易患上哪种疾病,提前预防…市场火热了十多年京西商城上面的那些基因检测产品,都是此类。
而str,是dna的短串重复序列,是指的dna序列上某些固定序列的重复,重复的数量,人与人之间也经常不同。
如5’atcggagagagagagactagta3’这段序列,str指的就是其中的ga,重复了六次,而有些人是七次,有些人是五次,一般情况下,也不会引起个体太大的差异。
但是无论snp还是str,都可以作为乔飞鉴定的依据。
再次思考了一次自己的逻辑,乔飞觉得没有任何问题,果断的将自己具有2.7kb基因序列的全基因组数据,和蒋慕轩的基因数据,一起上传到梁晓慧做的程序中。
如果系统能够直接分析基因序列,就太好了,乔飞喃喃自语。
不过现在不用着急,系统以后会升级的,也许真的就会有这个功能也说不定,乔飞感觉对自己的系统,还是充满希望的,即使到现在也没搞清楚它升级的经验,到底是什么鬼。
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